Гуэрра начал писать стихи и новеллы на родном диалекте, когда во время войны находился в концентрационном лагере в Германии. Они составили его первый сборник, опубликованный в 1946 году. Он писал романы, рассказы и стихи на протяжении десяти лет, пока в 1956-м вместе с Элио Петри и Джузеппе Де Сантисом не создал свой первый сценарий для фильма «Люди и волки», который поставил Де Сантис.

Три года спустя Гуэрра написал сценарий «Приключения» (1960), фильма, с которого началось его долгое сотрудничество с одним из лучших режиссеров мира – Микеланджело Антониони, сотрудничество, в котором трудно отделить вклад режиссера от вклада сценариста – настолько похожим было их восприятие мира, где царит разобщенность.  

В 1967-м за сценарий фильма Антониони «Фотоувеличение» Гуэрра получил вторую номинацию на премию «Оскар» (впервые он был номинирован годом раньше за «Казанову-70» Марио Моничелли). Кроме Антониони, с которым Гуэрра сделал восемь фильмов, он работал с такими разными режиссерами как Франческо Рози, Дамиано Дамиани, Витторио Де Сика, Джузеппе Торнаторе, братья Тавиани и, конечно, Федерико Феллини.

Гуэрра писал сценарии не только для соотечественников, но и для Андрея Тарковского («Ностальгия», 1983), и для греческого режиссера Тео Ангелопулоса («Путешествие в Киферу», 1984). 

В 1975 году в Москве Тонино Гуэрра познакомился с редактором «Мосфильма» Элеонорой Яблочкиной, а два года спустя состоялась свадьба, свидетелями на которой были Андрей Тарковский и Микеланджело Антониони. 

Избранная фильмография сценариста:

2004. ЭРОС /EROS/, реж. Микеланджело Антониони

1996. ПЕРЕМИРИЕ /TRUCE, THE/, реж. Франческо Рози

1995. ЗА ОБЛАКАМИ /PAR-DELA LES NUAGES/, реж. Микеланджело Антониони, Вим Вендерс

1988. ПЕЙЗАЖ В ТУМАНЕ /TOPIO STIN OMIHLI/, реж. Тео Ангелопулос

1988. ШОРОХ ВОРОБЬИНЫХ КРЫЛЬЕВ  /FRULLO DEL PASSERO/, реж. Джанфранко Мингоцци

1987. ХРОНИКА ОБЪЯВЛЕННОЙ СМЕРТИ /CRONACA DI UNA MORTE ANNUNCIATA/, реж. Франческо Рози

1987. ДОБРОЕ УТРО, ВАВИЛОН /GOOD MORNING, BABYLON/, реж. Паоло и Витторио Тавиани

1982. ПЧЕЛОВОД /MELISSOKOMOS, O/, реж. Тео Ангелопулос

1986. ДЖИНДЖЕР И ФРЕД /GINGER E FRED/, реж. Федерико Феллини

1984. ХАОС /KAOS/, реж. Паоло и Витторио Тавиани, премия David di Donatello и премия Итальянского синдиката киножурналистов за лучший сценарий

1984. ПУТЕШЕСТВИЕ В КИФЕРУ /TAXIDI STA KYTHIRA/, реж. Тео Ангелопулос, приз Каннского МКФ за лучший сценарий

1984. КАРМЕН /CARMEN/, реж. Франческо Рози

1983. И КОРАБЛЬ ПЛЫВЕТ /E LA NAVE VA/, реж. Федерико Феллини, премия David di Donatello за лучший сценарий

1983. НОСТАЛЬГИЯ /NOSTALGHIA/, реж. Андрей Тарковский

1982. ИДЕНТИФИКАЦИЯ ЖЕНЩИНЫ /IDENTIFICAZIONE DI UNA DONNA/, реж. Микеланджело Антониони

1982. НОЧЬ СВЯТОГО ЛОРЕНЦО /NOTTE DI SAN LORENZO, LA/, реж. Паоло и Витторио Тавиани, премия Итальянского синдиката киножурналистов за лучший сценарий

1981. ТАЙНА ОБЕРВАЛЬДА /MISTERO DI OBERWALD, IL/, реж. Микеланджело Антониони

1979. ТИГРЫ В ГУБНОЙ ПОМАДЕ /ДИКИЕ ПОСТЕЛИ /LETTI SELVAGGI /TIGERS IN LIPSTICK/, реж. Луиджи Дзампа

1979. ХРИСТОС ОСТАНОВИЛСЯ В ЭБОЛИ /CRISTO SI E FERMATO A EBOLI/, реж. Франческо Рози

1978. МОТЫЛЕК НА ПЛЕЧЕ /UN PAPILLON SUR L'ÉPAULE/, реж. Жак Дере

1976. СИЯТЕЛЬНЫЕ ТРУПЫ /CADAVERI ECCELLENTI/, реж. Франческо Рози

1974. ЛАКИ ЛЮЧАНО /LUCKY LUCIANO/, реж. Франческо Рози

1973. АМАРКОРД /AMARCORD/, реж. Федерико Феллини, номинация на премию «Оскар» и премия Итальянского синдиката киножурналистов за лучший сценарий  

1972. ПЛОТЬ ФРАНКЕНШТЕЙНА /FLESH FOR FRANKENSTEIN/, реж. Пол Морисси, Антонио Маргерити

1972. ДЕЛО МАТТЕИ /CASO MATTEI, IL/, реж. Франческо Рози

1970. ПОДСОЛНУХИ /I GIRASOLI/, реж. Витторио Де Сика

1969. ЗАБРИСКИ ПОЙНТ /ZABRISKIE POINT/, реж. Микеланджело Антониони

1968. ЛЮБОВНИКИ /AMANTI/, реж. Витторио Де Сика

1966. ФОТОУВЕЛИЧЕНИЕ /БЛОУ-АП /BLOW-UP/, реж. Микеланджело Антониони, номинация на премию «Оскар» за лучший сценарий

1965. ДЕСЯТАЯ ЖЕРТВА /DECIMA VITTIMA, LA/, реж. Элио Петри

1965. КАЗАНОВА-70 /CASANOVA’ 70/, реж. Марио Моничелли, номинация на премию «Оскар» за лучший сценарий

1964. КРАСНАЯ ПУСТЫНЯ /DESSERTO ROSSO, IL/, реж. Микеланджело Антониони

1964. БРАК ПО-ИТАЛЬЯНСКИ /MATRIMONIO ALL'ITALIANA/, реж.Витторио Де Сика

1962. ЗАТМЕНИЕ /L'ECLISSE/, реж. Микеланджело Антониони

1961. УБИЙЦА /ASSASSINO, L'/, реж. Элио Петри

1961. НОЧЬ /NOTTE, LA/, реж. Микеланджело Антониони

1960. ПРИКЛЮЧЕНИЕ /L'AVVENTURA/, реж. Микеланджело Антониони

1956. ЛЮДИ И ВОЛКИ /UOMINI E LUPI/, реж. Джузеппе Де Сантис